研究テーマ
- バイオ分析化学~新規ケミカルプローブの創製と応用~
- ペプチド核酸プローブ・ペプチドプローブ・小分子リガンド・核酸アプタマーの合成と相互作用解析
- RNA結合性蛍光インジケーターの開発と薬剤スクリーニングへの応用
- ノンコーディングRNA・ウイルスRNA検出プローブの開発
- 細胞内RNAイメージング法の開発
- RNA tagの開発と膜タンパク質イメージングへの応用
- ヒアルロン酸検出プローブの開発と脳細胞外空間機能解析への応用
- DNA損傷検出プローブの開発
生命現象を分子レベルで解明することは、21世紀の化学が担うべき魅力的な研究課題です。私たちは、高度な生命現象を司るキープレイヤーとしてのRNA、特に、これまでガラクタ同然と思われていた、タンパク質に翻訳されないRNA(ncRNA)を主要な研究対象として、RNAの新しい機能を明らかにしうる細胞内可視化プローブや検出プローブ、蛍光インジケーターの開発を進めています。また、RNAを内包し、細胞間コミュニケーションに重要な役割を果たしている細胞外小胞(エクソソーム)も主要な研究対象で、細胞外小胞の未知の機能を明らかにしうる検出プローブの開発も進めています。
このように、私たちの研究グループでは、RNAやRNA-タンパク質複合体、細胞外小胞の機能を解明するためのケミカルプローブを創製し、これらに基づく検出・疾患診断・機能解析法や創薬の支援ツールを提案・開発することで、生命科学の発展に貢献することを目指しています。
代表的論文
- "Deep-red light-up signaling of benzo[c,d]indole-quinoline monomethine cyanine for imaging of nucleolar RNA in living cells and for sequence-selective RNA analysis"
Y. Yoshino, Y. Sato, S. Nishizawa,Anal. Chem., 91, 14254-14260 (2019). - "Strong binding and off-on signaling functions of deep-red fluorescent TO-PRO-3 for influenza A virus RNA promoter region"
Y. Sato, Y. Aiba, S. Yajima, T. Tanabe, K. Higuchi, S. Nishizawa, ChemBioChem., 20, 2752-2756(2019) - "Trimethine cyanine dyes as deep-red fluorescent indicators with high selectivity to the internal loop of the bacterial A-site RNA"
Y. Sato, S. Yajima, A. Taguchi, K. Baba, M. Nakagomi, Y. Aiba, S. Nishizawa, Chem. Commun., 55, 3183–3186 (2019) - "Fluorescent trimethylated naphthyridine derivative with an aminoalkyl side chain as the tightest non-aminoglycoside ligand for the bacterial A-site RNA"
Y. Sato, M. Rokugawa, S. Ito, S. Yajima, H. Sugawara, N. Teramae, S. Nishizawa, Chem. Eur. J., 24, 13862–13870(2018) - "Optimization of the Alkyl Linker of TO Base Surrogate in Triplex-Forming PNA for Enhanced Binding to Double-stranded RNA"
T. Sato, Y. Sato, S. Nishizawa, Chem. Eur. J., 23, 14079–4088 (2017) - "Triplex-forming Peptide Nucleic Acid Having Thiazole Orange as a Base Surrogate for Fluorescence Sensing of Double-stranded RNA"
T. Sato, Y. Sato, S. Nishizawa, J. Am. Chem. Soc., 138, 9397-9400 (2016) - "Synthetic fluorescent probes capable of selective recognition of 3'-overhanging nucleotides for siRNA delivery imaging"
T. Sato, Y. Sato, K. Iwai, S. Kuge, S. Nishizawa, N. Teramae, Chem. Commun., 51, 1421-1424 (2015) - "Abasic Site-Binding Ligands Conjugated with Cyanine Dyes for "Off-On" Fluorescence Sensing of Orphan Nucleobases in DNA Duplexes and DNA/RNA Hybrids"
Y. Sato, M. Kudo, Y. Toriyabe, S. Kuchitsu, C.-X. Wang, S. Nishizawa, N. Teramae, Chem. Commun., 50, 515-517 (2014) - "Strong and Selective Binding of Amiloride to an Abasic Site in RNA Duplexes: Thermodynamic Characterization and MicroRNA Detection"
Y. Sato, T. Ichihashi, S. Nishizawa, N. Teramae, Angew. Chem. Int. Ed., 51, 6369-6372 (2012)